pQTL（Protein Quantitative Trait Loci）是指與蛋白質表達水平相關的遺傳變異位點。這些遺傳變異能夠影響特定基因的轉錄、翻譯或降解蛋白質等過程，進而影響人體中的蛋白質水平。pQTL是基因組關聯研究（Genome-Wide Association Studies, GWAS）的一個分支，專注於探索基因型與蛋白質表達水平之間的關聯。
研究者通過高通量測序技術來測量大量個體的蛋白質表達水平，並將這些數據與相應個體的基因型數據進行比較，以識別與特定蛋白質水平相關的遺傳變異。pQTL的發現有助於我們理解個體之間蛋白質水平的差異，以及這些差異與健康、疾病等生物學過程之間的關係。
pQTL可以分為兩類：
順式pQTL（cis-pQTL）：這類pQTL靠近編碼蛋白質的基因。
反式pQTL（trans-pQTL）：這類pQTL距離編碼蛋白質的基因較遠，通常位於不同染色體上。