魚油的正確服用方式通常包括以下幾個要點：
服用時間：魚油最好在飯後30分鐘內或隨餐服用，這樣可以提高魚油的吸收效果，也能減少胃腸不適感。隨餐服用並不是把魚油液體從膠囊中倒出來拌到飯裏面喫，而是單獨用水整顆吞服魚油膠囊。
服用劑量：一般每天建議攝入500至2000mg的Omega 3脂肪酸。魚油產品都會在包裝上明確註明服用方法和用量，所以購買後應仔細閱讀產品詳情瞭解正確的服用方法。
服用方式：魚油一般都是膠囊產品，最好是冷水吞服，剛服用過後最好不要馬上大量飲水，否則會降低胃腸中的脂肪濃度，影響吸收效率。
保存方法：魚油應存放在陰涼、乾燥的地方，避免陽光直射，以免影響其質量。
服用頻率：如果是以保健爲目的，建議每天服一次，每次一粒，晚上服用可能對預防中風腦梗發作有一定的作用。如果是以治療爲目的，開始可用較大劑量，每天兩次，早晚各一粒，3個月以後可減少，每天一次，每次一粒，以維持療效。
需要注意的是，魚油一般含有一股魚腥味，咬破膠囊服用可能會導致噁心、反胃和嘔吐，導致魚油攝入不足。因此，不建議咬破膠囊服用。