《魔界村》的故事發生在日本戰國時期，玩家扮演的忍者主角在前往消滅魔王的過程中，意外闖入一個名為“魔界村”的危險地帶，遇到了各種不同出身的敵人，經歷了一場場驚心動魄的戰鬥
。
玩家要面對的是層層關卡，而且每個關卡都會有一次讓人費解的謎題需要解決，這都需要玩家的智慧來解開。同時，戰鬥系統也是相當的硬派，戰鬥中會隨機會出現“連攜攻擊”，就是兩名敵人會一起攻擊主角，或者主角與NPC角色一起攻擊敵人，甚至NPC之間也會發生這種連攜現象。戰鬥系統主要採用的是回合制戰鬥，但並非一成不變，玩家可以自由選擇攻擊方式，並且可以通過組合各種忍術和技能來擊敗敵人。
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