電子監管碼的查詢方式有多種，包括：
通過簡訊查詢。在簡訊中輸入藥品電子監管碼，傳送到106695001111。
使用手機客戶端套用。下載並安裝「中國食藥監管」或「藥品管家」等手機客戶端，使用其中的掃碼功能掃描藥品上的電子監管碼進行查詢。
使用支付寶套用。在支付寶APP中選擇「城市服務」中的「醫療」選項，然後找到「掃碼驗真」功能，使用該功能掃描藥品上的電子監管碼。
通過電話查詢。撥打95001111或114轉電子監管網，按照語音提示輸入電子監管碼進行查詢。
線上查詢。登錄中國藥品電子監管網（http://www.drugadmin.com）或中國產品質量電子監管網（http://www.95001111.com），輸入電子監管碼進行查詢。