速溶咖啡中確實可能含有反式脂肪酸，主要來源於咖啡伴侶（植脂末、奶精）等輔料。
反式脂肪酸是一種不完全健康的不飽和脂肪酸，可以增加人體內低密度脂蛋白（壞膽固醇）的水平，同時降低高密度脂蛋白（好膽固醇）的水平，從而對血脂健康產生不良影響。長期攝入含有反式脂肪酸的食品可能會增加心腦血管疾病的風險。然而，某些情況下，反式脂肪酸也可能對人體產生積極的影響，如適量攝入可能有助於降低患心血管疾病的風險。對於特殊人群，如孕婦、老年人和兒童，建議減少或避免飲用含有反式脂肪酸的速溶咖啡。
此外，市面上也有一些品牌生產不含反式脂肪或反式脂肪含量極低的咖啡伴侶和速溶咖啡，消費者在選擇時可以加以留意。