豆粕和棉粕作為動物飼料的主要蛋白質來源，它們在營養成分、使用效果、適用範圍等方面存在顯著差異：
營養成分。豆粕是豆類油加工過程中的副產品，其特點是高蛋白質（約40%-50%）和相對較少的纖維素。豆粕中的蛋白質含量高，適合作為畜禽的高蛋白飼料。相比之下，棉粕來源於棉籽油加工，其蛋白質含量較低（約20%），但含有更多的纖維素。
使用效果。豆粕適宜於生長速度快的家畜或禽類，但長時間食用可能會導致脹氣等消化問題。而棉粕由於含纖維素較高，適合長時間食用，但可能會影響畜禽的食慾。
適用範圍。豆粕主要適用於豬、雞、鴨等禽畜，而棉粕則適用於牛、羊等反芻動物。
價格。豆粕的市場價格通常比棉粕高。