《馭鮫記》的結局是相對圓滿的。主要情節和角色結局如下：
女主角紀雲禾最初是馭妖師，與鮫人長意相愛，並幫助他獲得自由。在故事的發展中，紀雲禾犧牲自己封印了大反派順德公主，三百年後得以重生，並與長意重逢，兩人最終在一起，實現了愛情和自由的願望。
在故事的尾聲，紀雲禾和長意都長出了魚尾，象徵著他們不再受限於人類的身份，可以自由地在水中游弋。他們一起比賽游泳，攜手看盡山河，過上了幸福的生活。
其他角色如洛錦桑和空明也找到了自己的幸福，洛錦桑在紀雲禾和長意雲遊後幫助打理了北淵，並與空明在一起，有了屬於他們的孩子。
離殊為了拯救蒼生而死，最終迎來了一世凡人的軀體，與三月再度重逢。
整體來說，《馭鮫記》展現了一段跨越三世、充滿挑戰和犧牲的愛情故事，但最終以主角們的幸福生活告終，體現了愛情和自由的勝利。