耐力跑時的呼吸方法對於跑步的表現和身體的恢復至關重要，主要可以遵循以下幾種方法：
控制呼吸與步伐的節奏。這包括慢吸快呼法（每跑兩到三步吸氣一次，再每跑兩到三步呼氣一次），適合初學者；快吸慢呼法（每跑一步吸氣一次，再每跑一步呼氣一次），適合經驗豐富的跑者，能增加吸氧量；兩步一吸兩步一呼法，適合大多數人；三步一吸三步一呼法，適合長跑等耐力運動。
呼吸配合。口鼻同時使用可以增加通氣量，減少呼吸肌負擔，腹式呼吸有助於增強心肺功能。
根據跑步強度調整呼吸方法。輕度或中度跑步時，可以採用三步呼吸法甚至僅用鼻子呼吸；速度加快時，應轉為鼻吸口呼的方式；衝刺加速時，可能需要採用一步呼吸法。
此外，全程鼻子呼吸適合初跑者，可以保持較慢的速度和節奏。