碘液染色主要是通過碘液與被染色物質發生化學反應，從而改變被染色物質的顏色。具體來說，碘液可以與多種物質發生反應，產生不同的顏色變化。例如，碘液與澱粉接觸後，會形成碘-澱粉複合物，呈現藍色或藍黑色。此外，碘液還可以與糖原發生反應，形成棕褐色斑塊。在生物醫學領域，碘液常用於糞便、尿液等液體狀標本的染色，以及衣原體、吞噬細胞和阿米巴等的鑑別。
碘液染色的具體步驟可能因染色對象的不同而有所差異。例如，對於糞便標本，可以先將糞便塗片，然後滴加碘液進行染色。對於衣原體等微生物的染色，可能需要先將標本固定，然後滴加碘液進行染色。
總的來說，碘液染色的過程主要是通過碘液與被染色物質的化學反應，產生特定的顏色變化，從而達到染色的目的。