被孫恩的義軍所殺
王凝之的死因是被孫恩的義軍所殺。具體過程如下：
王凝之在孫恩攻打會稽時，沒有認真備戰，而是寄希望於“鬼兵”。他對手下人說：“已請大道，借鬼兵守諸津要，各數萬，賊不足憂也。”
然而，“鬼兵”並未出現，孫恩的義軍攻破會稽。王凝之見事不妙，準備逃跑，但最終被擒殺。
另一種說法是，王凝之並不相信與他一樣信仰五斗米教的孫恩會謀反。等叛軍逼近時，他纔不得不相信，卻不組織軍隊抵禦，而是踏星步鬥，拜神起乩，說是請下鬼兵守住各路要津，賊兵不能犯。結果城被攻破，王凝之仍然不相信同一教派的孫恩會殺他，並不逃走，最終被一刀梟首。
綜上所述，王凝之的死因是被孫恩的義軍所殺，他的死因與他的迷信和疏忽大意有關。