商業模式設計的方法主要包括六種，分別是全盤複製法、借鑑提升法、逆向思維法、相關分析法、關鍵因素法則和價值創新法。
全盤複製法：簡單複製經營狀況良好的企業的商業模式，根據自身企業狀況稍加修正，主要適契約行業的企業，特別是細分市場、目標客戶、主要產品相近或相同的企業。
借鑑提升法：通過引用創新點來學習優秀商業模式的方法，適用範圍最為廣泛，對不同行業、不同定位的企業者適用。
逆向思維法：通過對行業領導者商業模式或行業內主流商業模式的研究學習，模仿者有意識地實施反向學習。
相關分析法：在分析某個問題或因素時，將與這只是或因素相關的其他問題或因素進行對比，分析其相互關係或相關程度的一種分析方法。
關鍵因素法則：以關鍵因素為依據來確定商業模式設計的方法，五個步驟分別是確定商業模式設計的目標，識別所有的關鍵因素、分析影響商業模式的各種因素及其子因素，確定商業模式設計中不同階段的關鍵因素，明確各關鍵因素的性能指標和評估標準，制定商業模式的實施計劃。
價值創新法：對一些從未出現過的商業模式設計，往往需要進行創新，即通過價值要素的構建、組合等設計出新的商業模式。