核苷酸的平均分子量取決於其具體形式，包括磷酸化的程度和所含鹼基的類型。以下是幾種不同核苷酸的平均分子量：
三磷酸核糖核苷酸的平均分子量為499.5。
單磷酸核糖核苷酸的平均分子量為339.5。
三磷酸脫氧核糖核苷酸的平均分子量為487.0。
單磷酸脫氧核糖核苷酸的平均分子量為327.0。
對於無水的單個核苷酸，不同鹼基的分子量分別為：
腺嘌呤(A): 313.21
胸腺嘧啶(T): 304.2
胞嘧啶(C): 289.18
鳥嘌呤(G): 329.21
粗略估計，一個DNA核苷酸（在鹽溶液中）的平均分子量為325道爾頓。這個值可以用來計算單鏈DNA分子的分子量，通過將鹼基對的數量乘以每個鹼基的平均分子量（325道爾頓/鹼基）來得出。
綜上所述，核苷酸的平均分子量根據其具體類型和形式有所不同，但通常在300到500道爾頓之間。