接合子在不同的領域有不同的含義：
在非結合代數中，接合子是用來度量給定的三個元素結合性的一個元素。設A是非結合代數，對任意x,y,z∈A，稱(x,y,z)=(xy)z-x(yz)為x,y,z的接合子。在結合代數中，每個接合子都是0。
在細菌和放線菌中，通過細胞與細胞的直接接觸而產生的遺傳信息的轉移和重組過程，稱為接合。通過接合而獲得新遺傳性狀的受體細胞，稱為接合子。
在某些真菌，細菌，綠藻和原生動物中進行有性生殖時，兩個細胞互相靠攏形成接合部位，並發生細胞壁融合而生成接合子，由接合子發育成新個體，這樣的生殖方式稱為接合生殖。
在被子植物的受精過程中，花粉管中除管核外，可以有兩枚精核。當精核進入胚囊後，一枚精核與卵核接合而成為接合子；另一枚精核與極核結合，發育成三倍體的胚乳核，這種現象稱為雙重受精。
在某些真菌中，菌絲生出的結構基本相似，形態相同或略有不同的兩個配子囊接合而成，形成的結構稱為接合孢子。