孝賢皇后的死因存在多種說法，但根據現有的歷史記錄，最被廣泛接受的原因是她在東巡歸途中因病去世。以下是詳細的分析：
染病與病情惡化：
孝賢皇后在三月初四日染病，到三月十一日發病而亡，病程僅短短几天。
她的病情被描述爲“微感寒疾”，但並未立即引起重視，因爲她之前已經有過一次重大的身心打擊——她的愛子皇二子水琮在三個月前夭折。
缺乏直接證據：
官方記錄中缺失了關於孝賢皇后病情的詳細脈案，這是不尋常的，因爲清朝規定皇帝、皇后、妃嬪的病情都會有詳細的記錄。
可能的死因：
根據乾隆帝的自述，孝賢皇后在濟南時已感到不適，隨後在回京途中因病勢惡化而去世。這一說法得到了乾隆帝的認可，表明孝賢皇后的死因可能與她的健康狀況和旅途勞累有關。
其他說法：
儘管存在一些關於孝賢皇后死因的野史和傳說，如乾隆帝在御舟中招妓、孝賢皇后因羞憤投水而死等，但這些說法缺乏可靠的歷史證據支持，因此不被主流歷史學者所接受。
綜上所述，孝賢皇后的死因最可能是她在東巡歸途中因病勢惡化而去世。這一結論基於乾隆帝的自述和對當時情況的合理推測，儘管缺乏直接的醫療記錄，但已經足夠清晰地揭示了孝賢皇后的最後時刻。