咖啡豆的處理方法主要有以下幾種：
日曬處理法。這是最傳統的處理方法，將咖啡鮮果採摘後直接放在地面上或曬牀上進行乾燥，過程中會不斷翻動以保證均勻乾燥，乾燥後需去除果皮和果肉。
水洗處理法。首先去除咖啡鮮果的果皮和果肉，然後放入發酵槽進行溼發酵，發酵過程中會分解咖啡果膠，發酵完畢後使用清水將帶殼的咖啡豆清洗乾淨，再進行乾燥，特點是酸質明亮、口感乾淨、風味複雜度低。
蜜處理法。先去除咖啡櫻桃上的部分果皮和果膠，再進行發酵和乾燥，通常介於水洗與日曬之間，能在有着不錯乾淨度的同時含有豐富的水果風味。
厭氧處理法。這種處理法有別於一般日曬法容易造成水果過度發酵的味道，厭氧發酵可精準控制發酵時間以避免發酵過度，因此，能獲得比傳統處理法更飽滿的香氣與純淨的口感。
溼刨法。印度尼西亞當地的一種傳統處理方法，指在帶果膠的咖啡果實還沒有曬乾的時候，就把咖啡豆取出來，咖啡豆的溼度大概是30%-40%特別軟，表面有一些刮傷，後面的晾曬中會有輕微的發酵，從而產生獨特的風味。
每種處理方法都有其獨特的風味特點，選擇適合咖啡豆特性的處理方法可以更好地展現咖啡的風味。