沉水植物是指植物體全部位於水層下面，依賴固着生存的大型水生植物。
沉水植物的根有時不發達或退化，植物體的各部分都可吸收水分和養料，其通氣組織特別發達，這有利於在水中缺乏空氣的情況下進行氣體交換。這類植物的葉子大多爲帶狀或絲狀，例如苦草、金魚藻、狐尾藻和黑藻等。沉水植物對水質有一定的要求，因爲水質渾濁會影響其光合作用，儘管花小且花期短，但它們主要以觀葉爲主。
沉水植物在維持湖泊的清水穩態中具有重要作用，隨着沉水植物的消失，湖泊可以從清水狀態轉化成濁水狀態。沉水植物還能吸收水體中的營養物質，包括氮、磷等，對緩解水體富營養化起到積極作用。