「三司十三局」指香港特別行政區行政長官（特首）以下的三司和十三局。
三司：政務司、財政司、律政司。三司司長是政務司司長、財政司司長和律政司司長，直接向特首負責。
十三局：公務員事務局、政制及內地事務局、教育局、環境局、食物及衛生局、民政事務局、勞工及福利局、保全局、運輸及房屋局、商務及經濟發展局、發展局、財經事務及庫務局等十三個決策局，由政務司司長和財政司司長共同管理。
此外，香港特別行政區政府架構下還有諸多執行部門，例如衛生署、警務處等，其中警務處直接隸屬於保全局。香港特別行政區政府的這一架構體現了其獨特的政治體制和行政制度。